More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3755 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 113 aa  219  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  75.89 
 
 		 115 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  74.34 
 
 		 115 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  70.27 
 
 		 115 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  73.21 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  73.39 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  69.37 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  71.56 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  70.54 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  70.64 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  73.83 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 113 aa  160  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  64.6 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  66.97 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  66.97 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  67.27 
 
 		 113 aa  156  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  66.97 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  63.39 
 
 		 114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 115 aa  154  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  154  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 113 aa  153  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 119 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 120 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 114 aa  150  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  150  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  65.77 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  60.18 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 115 aa  146  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  63.81 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 115 aa  144  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>