91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3227 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  48.19 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  48.42 
 
 
193 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  46.96 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  45.86 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  46.78 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  47.78 
 
 
201 aa  170  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  43.89 
 
 
192 aa  168  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  44.89 
 
 
192 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  44.38 
 
 
190 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  44.89 
 
 
192 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  43.58 
 
 
195 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  43.18 
 
 
191 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  43.58 
 
 
200 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  43.82 
 
 
190 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  45.56 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  45.25 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  45.25 
 
 
200 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  41.48 
 
 
191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  42.13 
 
 
189 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  43.58 
 
 
191 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  44.38 
 
 
192 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  43.58 
 
 
191 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  41.48 
 
 
190 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  43.68 
 
 
187 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  43.68 
 
 
187 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  41.34 
 
 
195 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  43.75 
 
 
189 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  43.75 
 
 
189 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  39.79 
 
 
195 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  40.78 
 
 
208 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  39.79 
 
 
195 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  40.11 
 
 
194 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  41.9 
 
 
191 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  44.07 
 
 
194 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  45.66 
 
 
196 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  38.62 
 
 
191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  38.62 
 
 
191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  42.31 
 
 
197 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1357  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  40.78 
 
 
191 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  40.78 
 
 
191 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  39.11 
 
 
191 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  36.46 
 
 
191 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  38.64 
 
 
200 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  41.57 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  36.46 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  39.15 
 
 
184 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  40.56 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  39.23 
 
 
192 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  39.23 
 
 
192 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
185 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  36.61 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  37.91 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 
193 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  36.41 
 
 
193 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  37.43 
 
 
187 aa  121  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  36.13 
 
 
193 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  32.08 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  30.86 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  32.08 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  28.32 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  27.67 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  28.3 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  25.41 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  25.58 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  26.36 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  27.66 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  21.33 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  26.44 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1494  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00235804  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3483  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.140035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0322  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00462058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2620  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
179 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1790  hypothetical protein  36.92 
 
 
87 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6321  hypothetical protein  27.12 
 
 
172 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469279  normal  0.910042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1321  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1350  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.946881  hitchhiker  0.0000000359977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4303  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1051  protein of unknown function DUF820  29.47 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0285636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0659  hypothetical protein  34 
 
 
73 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 
199 aa  41.2  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>