82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3972 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
192 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  45.45 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  45.31 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  45.88 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  44.68 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  44.74 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  44.63 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  44.68 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  43.75 
 
 
195 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  44.38 
 
 
193 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  45.4 
 
 
192 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  43.5 
 
 
191 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  45.4 
 
 
191 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  43.32 
 
 
194 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  44.25 
 
 
191 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  43.01 
 
 
189 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  43.18 
 
 
192 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  42.55 
 
 
190 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  40.76 
 
 
192 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  43.01 
 
 
189 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  44.77 
 
 
200 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  45.41 
 
 
187 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  41.81 
 
 
208 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  45.41 
 
 
187 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  41.81 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  41.81 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  43.68 
 
 
192 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  42.37 
 
 
195 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  42.37 
 
 
195 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  42.55 
 
 
191 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  42.55 
 
 
191 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  42.94 
 
 
192 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  42.94 
 
 
192 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  42.94 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  40.68 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  42.94 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  43.18 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  42.11 
 
 
190 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
190 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  40.11 
 
 
200 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  41.86 
 
 
193 aa  141  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  40.91 
 
 
200 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  42.35 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  38.95 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  41.54 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  41.54 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  38.64 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
193 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  40.61 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  39.55 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  36.72 
 
 
185 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1357  hypothetical protein  36.72 
 
 
204 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  36.46 
 
 
194 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  36.16 
 
 
184 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  38.76 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
185 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  32.48 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  31.85 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  32.09 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  26.4 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  27.67 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  27.04 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  26.88 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  26.42 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  28.77 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1790  hypothetical protein  46.77 
 
 
87 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  26.57 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  29.85 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1493  hypothetical protein  36.11 
 
 
83 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00105107  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3655  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
187 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  26.85 
 
 
185 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6321  hypothetical protein  24.49 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469279  normal  0.910042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4506  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4303  protein of unknown function DUF820  41.18 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3926  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746975  normal  0.685888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>