More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0327 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  89.31 
 
 		 159 aa  300  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  44.52 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  42.68 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  45.33 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  44.3 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  43.51 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  42.04 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  39.22 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  40.52 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  39.49 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  45.8 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  41.18 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  40.67 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  42.34 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  43.85 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  36.84 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  40.79 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  42.31 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  39.29 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  39.35 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  39.44 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  39.29 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  38.57 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  37.06 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  40.56 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  40.56 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  40.56 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  38.03 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  39.29 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  37.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  37.86 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  37.86 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  35.81 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  35.81 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  35.81 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  35.06 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  35.06 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  37.32 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  35.14 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  34.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  32.68 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  34.67 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  34 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 		 175 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  36.23 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  34 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  31.33 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  32.67 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  32.67 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  32.67 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  31.33 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  29.33 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.67 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  32.67 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  36.18 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  33.33 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  33.33 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  32 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  30.67 
 
 		 165 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  31.82 
 
 		 181 aa  87  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  32 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  31.51 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  32.21 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>