More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0807 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  100 
 
 
348 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  54.2 
 
 
358 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  52.59 
 
 
346 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  53.94 
 
 
349 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  50.72 
 
 
346 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  53.37 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.07 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  39.72 
 
 
441 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  38.27 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  40.17 
 
 
442 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  41.14 
 
 
433 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.01 
 
 
421 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  40.56 
 
 
425 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  40.39 
 
 
435 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  38.7 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  39.28 
 
 
400 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  38.68 
 
 
368 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  40 
 
 
383 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  38.7 
 
 
365 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  38.7 
 
 
360 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  37.07 
 
 
360 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  40.11 
 
 
399 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  37.64 
 
 
368 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  37.64 
 
 
368 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  40.06 
 
 
375 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  37.97 
 
 
400 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  37.07 
 
 
368 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  41.75 
 
 
367 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  40.36 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  37.36 
 
 
368 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  36.86 
 
 
365 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.49 
 
 
388 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  38.75 
 
 
365 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  38.33 
 
 
368 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  39.65 
 
 
386 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  39.04 
 
 
394 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.6 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  36.47 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  37.43 
 
 
367 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  37.5 
 
 
365 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  39 
 
 
430 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.83 
 
 
412 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.49 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  37.75 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  36.23 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  36.98 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  39.82 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  37.74 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.34 
 
 
377 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.34 
 
 
377 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  39.23 
 
 
407 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  31.69 
 
 
337 aa  189  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  32.47 
 
 
332 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.81 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  31.25 
 
 
322 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.02 
 
 
330 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.04 
 
 
301 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.06 
 
 
298 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  33.92 
 
 
302 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  32.46 
 
 
302 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  32.85 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  32.54 
 
 
304 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.73 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.64 
 
 
317 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  32.65 
 
 
302 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  32.84 
 
 
304 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  30.46 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  31.12 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  33.43 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  34.12 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.43 
 
 
307 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  32.76 
 
 
323 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.82 
 
 
306 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.5 
 
 
303 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  31.61 
 
 
304 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  30.37 
 
 
329 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.09 
 
 
303 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  29.83 
 
 
333 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.21 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  32.66 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  33.24 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.63 
 
 
343 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  29.62 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  27.57 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  29.14 
 
 
321 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  29.82 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  32.99 
 
 
447 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  30.71 
 
 
313 aa  139  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  28.9 
 
 
301 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.24 
 
 
333 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  32.53 
 
 
447 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.4 
 
 
347 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  29.51 
 
 
332 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.56 
 
 
333 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>