More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0687 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  100 
 
 
337 aa  689    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  58.58 
 
 
346 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  53.37 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  52.34 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  52.66 
 
 
346 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  51.33 
 
 
358 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  46 
 
 
426 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  46.44 
 
 
425 aa  285  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  45.43 
 
 
360 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  45.8 
 
 
375 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  44.03 
 
 
442 aa  271  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.16 
 
 
421 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  42.94 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  44.32 
 
 
433 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  42.35 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  42.23 
 
 
368 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  42.23 
 
 
368 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  42.23 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  42.23 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  42.23 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  43.06 
 
 
379 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  42.98 
 
 
430 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  41.94 
 
 
368 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.47 
 
 
356 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  40.7 
 
 
365 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  41.64 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  41.94 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
360 aa  259  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.64 
 
 
384 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
365 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  44.61 
 
 
394 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  44.67 
 
 
367 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  41.35 
 
 
368 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  43.75 
 
 
367 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.81 
 
 
388 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  43.02 
 
 
365 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  45.1 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  41.47 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  41.93 
 
 
435 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  44.28 
 
 
397 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  41.16 
 
 
366 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  41.18 
 
 
365 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  43.66 
 
 
400 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.03 
 
 
388 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  43.7 
 
 
383 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.31 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  45.67 
 
 
395 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  42.31 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  39.13 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  43.54 
 
 
399 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  39.36 
 
 
366 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  41.85 
 
 
389 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.17 
 
 
377 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  38.26 
 
 
372 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.87 
 
 
377 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  38.3 
 
 
373 aa  222  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  44.14 
 
 
407 aa  222  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  35.99 
 
 
332 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  35.28 
 
 
337 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.44 
 
 
330 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.69 
 
 
302 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  38.91 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.58 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.81 
 
 
306 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.76 
 
 
298 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  36.14 
 
 
304 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.74 
 
 
301 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  38.63 
 
 
302 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  37.81 
 
 
306 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.45 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  38.77 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.66 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  37.11 
 
 
304 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  36.86 
 
 
304 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  37.11 
 
 
304 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.84 
 
 
331 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.28 
 
 
307 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  37.42 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  37.74 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  31.14 
 
 
304 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  36.61 
 
 
300 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  35.17 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.22 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  34.38 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  37.69 
 
 
302 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.28 
 
 
357 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  35.8 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  36.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  33.73 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.83 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.96 
 
 
304 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.57 
 
 
343 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.11 
 
 
303 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  39.13 
 
 
323 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  37.42 
 
 
305 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  37.45 
 
 
310 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.96 
 
 
304 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  37.39 
 
 
327 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  33.53 
 
 
322 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  36.11 
 
 
334 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>