More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1284 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  81.77 
 
 
384 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  100 
 
 
386 aa  798    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  78.51 
 
 
388 aa  641    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  75.59 
 
 
400 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  77.04 
 
 
397 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  76.38 
 
 
399 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  74.14 
 
 
388 aa  588  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  72.68 
 
 
394 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.73 
 
 
412 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  69.29 
 
 
383 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  69.82 
 
 
400 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  70.47 
 
 
395 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  72.02 
 
 
407 aa  522  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  62.28 
 
 
367 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  61.56 
 
 
367 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  58.08 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  58.26 
 
 
426 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  56.01 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  56.01 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  56.01 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  56.01 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  56.01 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  55.43 
 
 
368 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  55.72 
 
 
368 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  56.25 
 
 
365 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  54.47 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  55.13 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  57.65 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  55.13 
 
 
368 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  56 
 
 
365 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  57.35 
 
 
375 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  57.51 
 
 
366 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  53.67 
 
 
368 aa  391  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  56.45 
 
 
360 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  51.54 
 
 
442 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  54.55 
 
 
430 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  54.52 
 
 
365 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  56.21 
 
 
360 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  56.21 
 
 
365 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  53.63 
 
 
435 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  53.93 
 
 
433 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  56.56 
 
 
389 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  52.81 
 
 
441 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.69 
 
 
421 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  53.78 
 
 
366 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  52.99 
 
 
379 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.44 
 
 
356 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  51.4 
 
 
372 aa  333  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  48.88 
 
 
373 aa  319  6e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.11 
 
 
377 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.12 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  46.22 
 
 
346 aa  275  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  45.7 
 
 
337 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  43.55 
 
 
349 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  41.11 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  41.67 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  39.31 
 
 
332 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  39.04 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  39.94 
 
 
348 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.51 
 
 
330 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  38.35 
 
 
447 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  38.35 
 
 
447 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  35.94 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.65 
 
 
298 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.78 
 
 
303 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  34.9 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.72 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  36.07 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.06 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  35.2 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.12 
 
 
304 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  35.59 
 
 
307 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  34.31 
 
 
304 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  35.69 
 
 
304 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  34.99 
 
 
304 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  34.92 
 
 
334 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  35 
 
 
304 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  34.94 
 
 
334 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.17 
 
 
333 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.86 
 
 
308 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.13 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.67 
 
 
324 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  34.01 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  35.14 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  35.12 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  33.91 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.29 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.13 
 
 
331 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.33 
 
 
357 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  34.39 
 
 
322 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.26 
 
 
307 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.96 
 
 
333 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.06 
 
 
357 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.35 
 
 
306 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  34.71 
 
 
304 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.06 
 
 
347 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  34.12 
 
 
334 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  32.58 
 
 
370 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  34.89 
 
 
324 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  32.15 
 
 
304 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>