30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0648 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  47.64 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  50.54 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  45.88 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  46.33 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  41.09 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  40.71 
 
 		 337 aa  178  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  36.59 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  37.77 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  37.77 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  35.48 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  37.92 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  36.46 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  37.02 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  34.31 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  34.98 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  36.94 
 
 		 248 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  35.23 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  32.74 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.73 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  31.87 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.35 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  30.59 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  30.2 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  35.23 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  48.89 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>