21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0449 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  100 
 
 
126 aa  269  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  59.52 
 
 
126 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  54.76 
 
 
126 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  53.97 
 
 
126 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  49.59 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  46.92 
 
 
134 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  42.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  44.44 
 
 
137 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  41.46 
 
 
129 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  34.97 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  52.56 
 
 
121 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  48.15 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  35.43 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  32.77 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  32.76 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  32.23 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  26.87 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  25.6 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>