21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3546 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  100 
 
 		 573 aa  1165    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  27.82 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  22.49 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.78 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  24.41 
 
 		 515 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  38.96 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  22.12 
 
 		 496 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  37.78 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  33.33 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  40 
 
 		 257 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  22.73 
 
 		 362 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  26.57 
 
 		 341 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  37.21 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 278 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 278 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  32.41 
 
 		 423 aa  43.9  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  42.86 
 
 		 581 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>