40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2842 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  68.09 
 
 
298 aa  359  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  60.23 
 
 
307 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  59.69 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  48.58 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  51.15 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  60.12 
 
 
193 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  43.27 
 
 
256 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  42.86 
 
 
251 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  44.53 
 
 
258 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  44.26 
 
 
259 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  44.08 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  42.62 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  45.34 
 
 
255 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  43.03 
 
 
256 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  44.49 
 
 
269 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  38 
 
 
275 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  40 
 
 
262 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  37.65 
 
 
250 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  42.69 
 
 
269 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  38.93 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  36.92 
 
 
251 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  41.46 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  70.42 
 
 
95 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  29.1 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  25.59 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  23.75 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  24.12 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  24.2 
 
 
234 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  25.76 
 
 
177 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  23.5 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  24.87 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  27.55 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  21.37 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  29.2 
 
 
223 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  27.78 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  25.64 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  27.88 
 
 
634 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>