29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0015 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  64.77 
 
 
354 aa  244  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  66.48 
 
 
307 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  60.12 
 
 
268 aa  226  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  54.55 
 
 
298 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  45.2 
 
 
291 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  39.2 
 
 
259 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  41.07 
 
 
251 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  37.16 
 
 
258 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  37.5 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  41.76 
 
 
251 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  40.59 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  35.67 
 
 
267 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  40 
 
 
256 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  32.39 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  36.84 
 
 
269 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  33.53 
 
 
250 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  33.53 
 
 
250 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  34.09 
 
 
269 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  31.58 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  34.29 
 
 
251 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  32.34 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  26.51 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  25.37 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  25.68 
 
 
245 aa  45.1  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  24.17 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  26.51 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  32.95 
 
 
223 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>