40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0820 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  82 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  74.9 
 
 		 259 aa  401  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  81.12 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  80.56 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  70.2 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  79.61 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  47.81 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  43.9 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  43.27 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  42.21 
 
 		 354 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  45.27 
 
 		 298 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  43.85 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  42.62 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  41.87 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  39.92 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  39.83 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  36.4 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  49.7 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  46.95 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  41.72 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  61.76 
 
 		 95 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  28.78 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  25.67 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  24.52 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  33.59 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  33.59 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  23.28 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  18.89 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  30.47 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  24.41 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  28 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  24.12 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  23.83 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  22.03 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  26.39 
 
 		 634 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>