39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0131 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  82 
 
 		 256 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  85.66 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  75.51 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  73.2 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  75.81 
 
 		 259 aa  364  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  76.21 
 
 		 256 aa  362  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  50.42 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  42.86 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  44.35 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  45.9 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  42.68 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  46.69 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  44.13 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  45.38 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  41.77 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  37.1 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  42.04 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  37.45 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  47.88 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  37.96 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  38.12 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  41.07 
 
 		 193 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  56.34 
 
 		 95 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  28.5 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  26.77 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  33.07 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  33.07 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  22.67 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  29.2 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  21.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  21.3 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  24.74 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  32.18 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  31.52 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  20.95 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>