40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3340 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  81.12 
 
 		 256 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  85.66 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  72.06 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  73.58 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  78.78 
 
 		 259 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  77.42 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  49.18 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  44.08 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  41.43 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  46.94 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  43.87 
 
 		 354 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  45.23 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  43.44 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  42.74 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  41.37 
 
 		 291 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  36 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  47.9 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  46.06 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  38.59 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  38.02 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  40.49 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  41.76 
 
 		 193 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  57.75 
 
 		 95 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  31.53 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  27.88 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  31.65 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  31.65 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  30.94 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  31.4 
 
 		 177 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  23.11 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  30.1 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  26.72 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  19.44 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  28.04 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  22.17 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  21.67 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  23.48 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  26.88 
 
 		 634 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>