More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1890 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1890  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00906876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.4 
 
 
249 aa  205  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
276 aa  158  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.92 
 
 
267 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.11 
 
 
261 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.8 
 
 
260 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.52 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.83 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.26 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.85 
 
 
276 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.52 
 
 
270 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.15 
 
 
296 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.65 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.2 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.2 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.92 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.04 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.34 
 
 
281 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.72 
 
 
250 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3071  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.92 
 
 
298 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.44 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
263 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.61 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.65 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.89 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.24 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.43 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.99 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.3 
 
 
261 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.28 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.24 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.03 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.82 
 
 
301 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.21 
 
 
271 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.56 
 
 
265 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.6 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.17 
 
 
265 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.23 
 
 
301 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.68 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.68 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
280 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1060  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
284 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.29 
 
 
261 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.78 
 
 
257 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.96 
 
 
283 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.77 
 
 
254 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1088  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.3 
 
 
281 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.626064  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.02 
 
 
263 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.2 
 
 
280 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.28 
 
 
256 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.09 
 
 
291 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.09 
 
 
291 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.23 
 
 
266 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.85 
 
 
274 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.44 
 
 
268 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.49 
 
 
291 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.3 
 
 
253 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.4 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.84 
 
 
281 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0181566  normal  0.0698787 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.74 
 
 
269 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.89 
 
 
256 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.73 
 
 
291 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.73 
 
 
291 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.84 
 
 
303 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1112  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.57 
 
 
277 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000207078  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.73 
 
 
291 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.7 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.82 
 
 
269 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.24 
 
 
261 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.78 
 
 
251 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0992  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.98 
 
 
271 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
289 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
269 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.85 
 
 
261 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.42 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.13 
 
 
262 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.56 
 
 
270 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
303 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.47 
 
 
276 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.34 
 
 
287 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
265 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.35 
 
 
259 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.09 
 
 
287 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.03 
 
 
265 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.66 
 
 
270 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.35 
 
 
259 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.51 
 
 
289 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.64 
 
 
279 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.64 
 
 
279 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1308  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.33 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>