More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1513 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
107 aa  223  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  49.06 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
114 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
106 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  49.52 
 
 
106 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  44.34 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
106 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
128 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
116 aa  100  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
128 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
106 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
110 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.93 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.59 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  41.51 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
114 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
114 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
114 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
122 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  45 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00747  HesB protein family  41.51 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.57 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.25 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  42.45 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
115 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
125 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.14 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1565  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548609  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  39.62 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  42.16 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  39.62 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  39.05 
 
 
117 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  39.05 
 
 
130 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  39.05 
 
 
130 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  39.05 
 
 
117 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  39.05 
 
 
117 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  40.78 
 
 
117 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
114 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
114 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  39.05 
 
 
117 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
114 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
114 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
115 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>