132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0025 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0037  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  92.73 
 
 		 462 bp  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0044  tRNA-Cys  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0054  tRNA-Cys  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0033  tRNA-Cys  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0012  tRNA-Cys  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0384692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0009  tRNA-Cys  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705692  normal  0.0935108 
 
 
-
 
NC_006368  lppt35  tRNA-Cys  97.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt35  tRNA-Cys  97.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0030  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6040  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04005  tRNA-Cys  97.44 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0027    88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0021  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0026  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.285214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0031  tRNA-Cys  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.392405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA45  tRNA-Cys  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0027  tRNA-Cys  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.925736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0015  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0034  tRNA-Cys  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  95.12 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  95 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0022  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0007  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0039  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00215479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0025  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0022  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0022  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0650599  normal  0.0120275 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt05  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0032  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392433  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0582  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0063  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0072  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0032  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0454547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0068  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.080231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0034  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0037  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0075  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0001  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.536129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0077  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0077  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4584  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Cys-2  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0528288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2880  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4322  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.990872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1743  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319496  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0050  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2453  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2828  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0221727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2765  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0332395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2825  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1776  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00638418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0018  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0018  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0856  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.569143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0017  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0040  tRNA-Cys  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00117723  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0036  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.381254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0028  tRNA-Cys  88 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0023  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125865  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0041  tRNA-OTHER  88 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0035  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0029  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13880  tRNA-Cys  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0819816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0030  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15500  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0034  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000888056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0042  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0630788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0023  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0021  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0021  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3267  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0001  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0046  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0953188  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0055  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0022  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0036  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.423302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0030  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.737492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>