More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1550 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
429 aa  880  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
429 aa  880  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  99.77 
 
 
429 aa  879  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  99.77 
 
 
429 aa  879  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.24 
 
 
404 aa  461  1e-128  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 
433 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.37882e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 
433 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 
433 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  31.62 
 
 
406 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  31.62 
 
 
406 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.83 
 
 
402 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 
393 aa  206  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  36.97 
 
 
405 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  3.06123e-09 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.05 
 
 
406 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 
427 aa  121  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 
427 aa  121  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
427 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
427 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
427 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
427 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  7.96647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 
427 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  5.08366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
420 aa  112  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  26.79 
 
 
416 aa  110  4e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  26.79 
 
 
416 aa  110  4e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 
427 aa  109  9e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 
427 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  28.25 
 
 
414 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.21 
 
 
424 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.55 
 
 
412 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  26.74 
 
 
411 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.92616e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  25.88 
 
 
403 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  25.88 
 
 
403 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.88 
 
 
403 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0040  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
407 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  27.32 
 
 
411 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.73 
 
 
414 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1360  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
407 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.58925e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1194  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
407 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
407 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0251  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
407 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  25.88 
 
 
403 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  25.88 
 
 
403 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.56 
 
 
411 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  24.63 
 
 
425 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  24.63 
 
 
425 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0558  ISSep1-like transposase  27.62 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0544  ISSep1-like transposase  27.62 
 
 
337 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.76 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0160  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0380  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0577  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0260  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0991  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1730  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  9.71497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.59 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5641  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.08 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1810  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0565  ISSep1-like transposase  28.7 
 
 
337 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1019  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.197197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.353125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1911  ISSep1-like transposase  28.7 
 
 
337 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1132  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2701  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2674  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1293  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2083  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.70228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1551  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.73211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.39136e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1023  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.43141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.39746e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0728  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.10486e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0911  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.18715e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0697  ISSep1-like transposase  27.54 
 
 
337 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0266  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
425 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0865  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.45 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.03575e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2389  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.45 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.33705e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>