More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0544 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 291 aa  591  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.41 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  32.12 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  34.39 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  33.6 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.85 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.59 
 
 		 237 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  32.44 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.95 
 
 		 236 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.85 
 
 		 236 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  32.59 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  31.68 
 
 		 425 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.54 
 
 		 243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  35.53 
 
 		 435 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  32.44 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  35.16 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.77 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  32.18 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  32.43 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  35.35 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 		 244 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1382  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.344903  hitchhiker  0.00931102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  29.1 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  31.25 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  32.58 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  30.16 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.81 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.88 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  32.55 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.16 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.35 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  31.46 
 
 		 445 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  34.46 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.58 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  32.28 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  32.68 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  31.35 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  29.34 
 
 		 259 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  31.7 
 
 		 452 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1157  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  30.59 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  32.13 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  32.57 
 
 		 633 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  31.13 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  30.47 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  30.47 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  30.5 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.16 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.27 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.42 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 234 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  32.03 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  30.08 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  30.08 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  30.08 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  30.08 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  31.2 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  30.86 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  30.08 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.37 
 
 		 482 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.97 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  29.53 
 
 		 463 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 		 500 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  30.45 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  27.51 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  30.37 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.14 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>