217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6649 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
195 aa  405  1e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.19 
 
 
191 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
193 aa  180  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.79 
 
 
205 aa  179  3e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
192 aa  179  3e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  43.01 
 
 
192 aa  177  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  42.93 
 
 
201 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 
192 aa  173  2e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
193 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
192 aa  164  6e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
204 aa  160  8e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
192 aa  157  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 
507 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
216 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.62 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.45 
 
 
507 aa  151  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  39.38 
 
 
207 aa  146  2e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
192 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
191 aa  144  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  38.86 
 
 
207 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
197 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
192 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
192 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
218 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  1.99345e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
194 aa  127  8e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
197 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
196 aa  117  1e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.58 
 
 
191 aa  117  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.58 
 
 
191 aa  116  2e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
191 aa  116  2e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.11 
 
 
191 aa  116  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.05 
 
 
191 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.05 
 
 
191 aa  114  7e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.34 
 
 
189 aa  113  1e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.05 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.05 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
193 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.53 
 
 
191 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.53 
 
 
191 aa  111  7e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
195 aa  110  1e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
197 aa  110  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
192 aa  110  2e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
194 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.68 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
200 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.02 
 
 
199 aa  82  5e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 
196 aa  80.9  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.66 
 
 
199 aa  79.7  3e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 
194 aa  78.6  6e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.46 
 
 
192 aa  78.6  6e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.18 
 
 
206 aa  77.8  9e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  27.17 
 
 
189 aa  77  1e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
197 aa  77  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 
194 aa  77  2e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
196 aa  75.9  3e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
192 aa  76.3  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  32.58 
 
 
198 aa  74.3  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
261 aa  72.8  3e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.76 
 
 
200 aa  72.8  3e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.41 
 
 
200 aa  72.4  4e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.96 
 
 
261 aa  72.4  4e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.84 
 
 
193 aa  71.6  7e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
194 aa  71.6  7e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  27.89 
 
 
211 aa  71.2  8e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 
259 aa  70.9  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.32 
 
 
193 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.13 
 
 
193 aa  69.3  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.18 
 
 
193 aa  69.3  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
263 aa  68.9  4e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.32 
 
 
193 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.32 
 
 
193 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.32 
 
 
193 aa  68.9  5e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
193 aa  68.9  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.17 
 
 
265 aa  68.6  6e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.27 
 
 
206 aa  68.6  6e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  30.26 
 
 
259 aa  68.2  7e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 
259 aa  68.2  7e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  26.14 
 
 
213 aa  68.2  7e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.35 
 
 
194 aa  68.2  7e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 
259 aa  67.8  9e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
258 aa  67.8  1e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
197 aa  67  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
258 aa  67.8  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.45 
 
 
209 aa  67  1e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  25.79 
 
 
193 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
195 aa  66.2  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
265 aa  65.9  3e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  65.9  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.4 
 
 
222 aa  65.9  4e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.91 
 
 
193 aa  65.5  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
230 aa  65.9  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>