20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1790 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  64.93 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  64.75 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  59.95 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  52.45 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  43.5 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  41.46 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  39.62 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  35.93 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  35.67 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  36.05 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  31.14 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  32.97 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  32.63 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  33.88 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  33 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  28.25 
 
 		 594 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  25.54 
 
 		 930 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  33.63 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>