20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2835 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  95.29 
 
 		 361 aa  724    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  64.93 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  67.66 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  57.46 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  43.85 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  43.4 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  43.91 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  35.12 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  36.28 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  35 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  31.08 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  33.13 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  31.28 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  35.18 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  31.56 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  28.51 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  26.04 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  26.86 
 
 		 930 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  31.03 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>