19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0908 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  58.52 
 
 
370 aa  420  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  51.55 
 
 
363 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  43.85 
 
 
361 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  44.59 
 
 
361 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  41.58 
 
 
384 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  40.32 
 
 
368 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  39.28 
 
 
360 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  35.58 
 
 
371 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  35.16 
 
 
361 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  35.67 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  35.16 
 
 
370 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  32.28 
 
 
398 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  31.73 
 
 
482 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  31.91 
 
 
396 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  34.19 
 
 
326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  25.96 
 
 
541 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  25.96 
 
 
594 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  22.34 
 
 
930 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>