20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1706 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  66.2 
 
 
361 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  50.26 
 
 
398 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  50.82 
 
 
373 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  47.71 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  48.61 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  43.23 
 
 
482 aa  271  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  33.94 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  35.16 
 
 
379 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  33.17 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  32.63 
 
 
384 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  35.21 
 
 
368 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  33.24 
 
 
326 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  33.74 
 
 
361 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  33.13 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  32.52 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  29.94 
 
 
541 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  27.98 
 
 
594 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  28.09 
 
 
930 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  40.57 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>