20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7052 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  50.82 
 
 
370 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  50.82 
 
 
361 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  44.64 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  46.43 
 
 
371 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  42.93 
 
 
482 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  42.42 
 
 
396 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  36.26 
 
 
370 aa  186  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  35.49 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  35.67 
 
 
384 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  34.93 
 
 
363 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  34.86 
 
 
326 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  35 
 
 
361 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  36.71 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  35.21 
 
 
361 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  33.33 
 
 
541 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  33.82 
 
 
360 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  29.34 
 
 
594 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  45.28 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  26.55 
 
 
930 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>