20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0234 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  675    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  34.86 
 
 
373 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  35.43 
 
 
371 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  32.4 
 
 
361 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  33.24 
 
 
370 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  34.19 
 
 
379 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  35.9 
 
 
370 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  33.66 
 
 
396 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  31.45 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  33 
 
 
384 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  28.95 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  35.02 
 
 
360 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  32.89 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  31.56 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  27.15 
 
 
482 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  28.94 
 
 
368 aa  99  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  25.4 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  26.85 
 
 
930 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  30.34 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  26.44 
 
 
594 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>