79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1383 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  33.91 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  33.91 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.48 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  30.51 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.92 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.9 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  29.37 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  27.39 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.63 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.21 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.63 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.86 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.44 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.57 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  25.51 
 
 		 599 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.27 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.58 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 		 225 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.63 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.4 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.03 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.2 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.32 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.29 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.09 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.22 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.72 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.11 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.56 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.35 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  27.56 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  22.94 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  22.94 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  22.51 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  22.51 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  22.51 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  23.36 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.22 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  25.33 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.31 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.13 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.42 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.1 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.53 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.08 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.2 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.58 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.47 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  27.91 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.51 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.55 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.36 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.55 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  27.21 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  22.03 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.3 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.12 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.62 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0088  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.46 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.56 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.43 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0034  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.31 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0846524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.43 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.53 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.09 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.16 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  24.89 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.15 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.46 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0694  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.54 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0473101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.21 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.38 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  23.08 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.74 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.5 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>