29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1443 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  78.72 
 
 
397 aa  637  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  85.17 
 
 
391 aa  679  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  790  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  69.05 
 
 
391 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  65.38 
 
 
404 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  64.45 
 
 
391 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  61.18 
 
 
403 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  56.23 
 
 
404 aa  439  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  52.3 
 
 
392 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  48.22 
 
 
401 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  48.73 
 
 
405 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  50 
 
 
395 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  48.48 
 
 
441 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  48.49 
 
 
395 aa  362  7e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  91.37 
 
 
145 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  34.56 
 
 
394 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  33.94 
 
 
384 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  32.69 
 
 
387 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  28.03 
 
 
413 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  27.3 
 
 
398 aa  130  5e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  34.55 
 
 
426 aa  118  1e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  29.85 
 
 
429 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  64.71 
 
 
92 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  29.86 
 
 
384 aa  78.2  3e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  23.89 
 
 
394 aa  76.6  7e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  24.36 
 
 
381 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.57228e-12  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  29.44 
 
 
383 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  26.22 
 
 
408 aa  66.2  8e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  44.3 
 
 
101 aa  62  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>