More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2225 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
98 aa  200  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  4.82989e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  92.86 
 
 
98 aa  190  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  90.82 
 
 
98 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  88.78 
 
 
98 aa  184  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  86.73 
 
 
98 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.51364e-05  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  87.76 
 
 
98 aa  183  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  88.89 
 
 
99 aa  162  1e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 
89 aa  140  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  66.3 
 
 
94 aa  138  2e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  70.59 
 
 
93 aa  134  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
95 aa  133  7e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  66.28 
 
 
94 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
94 aa  132  2e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  132  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  9.95176e-06  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 
93 aa  132  2e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.15821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  69.05 
 
 
88 aa  131  2e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  67.82 
 
 
92 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.97643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
89 aa  130  8e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  129  1e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  71.76 
 
 
93 aa  129  1e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 
93 aa  129  1e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
94 aa  129  1e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
95 aa  129  1e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  4.85262e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
95 aa  128  2e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
93 aa  129  2e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  72.62 
 
 
92 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
94 aa  128  2e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  128  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.07565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  129  2e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
95 aa  128  2e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  70.59 
 
 
92 aa  129  2e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  72.62 
 
 
92 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  68.24 
 
 
93 aa  129  2e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  69.05 
 
 
93 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 
92 aa  127  4e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
90 aa  127  4e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  65.06 
 
 
93 aa  127  5e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 
92 aa  127  7e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.09655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  127  7e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
91 aa  126  8e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.95023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  61.29 
 
 
94 aa  126  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 
93 aa  126  1e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  126  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  64.29 
 
 
92 aa  125  1e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 
92 aa  125  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  63.1 
 
 
92 aa  125  2e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  125  2e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  125  2e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.91736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  125  2e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53887e-05  unclonable  3.38266e-12 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  57.78 
 
 
90 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.62124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
95 aa  124  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
93 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  124  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
93 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
94 aa  124  4e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  67.86 
 
 
92 aa  124  4e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  124  4e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 
93 aa  124  4e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
92 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  8.6131e-07 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
97 aa  124  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  61.7 
 
 
94 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.39943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.28304e-05  decreased coverage  4.75067e-05 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
94 aa  123  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  69.05 
 
 
86 aa  123  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  1.40006e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.19027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  64.44 
 
 
92 aa  123  8e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
94 aa  123  8e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
92 aa  123  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.85402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
95 aa  123  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.60903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56834e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.52177e-06  unclonable  4.39739e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.47318e-05  unclonable  8.36266e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  1.51604e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.00624e-06  unclonable  5.33461e-12 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.08032e-09  hitchhiker  1.25391e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.19443e-05  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86112e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
93 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.59577e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  62.22 
 
 
91 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.97601e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
94 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.45132e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.9175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  62.07 
 
 
88 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>