31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0783 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  790    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  69.67 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  69.05 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  68.64 
 
 		 391 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  67.44 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  66.75 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  62.95 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  58.9 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  54.34 
 
 		 392 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  51.52 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  50.76 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  51.15 
 
 		 395 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  49.3 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  49.75 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  34.21 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  35.23 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  71.53 
 
 		 145 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  33.06 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  28.68 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  32 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  82.35 
 
 		 92 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  34.46 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  31.18 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  29.1 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  24.69 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  28.14 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  24.1 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0776  hypothetical protein  29.66 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0148333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  32.1 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>