13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8529 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  100 
 
 
1939 aa  3924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  27.04 
 
 
3677 aa  83.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  27.03 
 
 
966 aa  74.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  33.09 
 
 
412 aa  59.3  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  23.26 
 
 
5185 aa  56.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  23.16 
 
 
3437 aa  55.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  26.47 
 
 
5128 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2793  hypothetical protein  34.78 
 
 
122 aa  53.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000246672  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  28.67 
 
 
3754 aa  51.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8840  hypothetical protein  29.09 
 
 
347 aa  51.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1091  hypothetical protein  28.16 
 
 
333 aa  50.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.54384e-60 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  31.45 
 
 
1465 aa  48.9  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  29.69 
 
 
670 aa  48.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>