235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8379 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  69.5 
 
 
262 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  68.2 
 
 
260 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  67.69 
 
 
260 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  66.02 
 
 
260 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  67.69 
 
 
258 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  63.32 
 
 
256 aa  344  7e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  61.39 
 
 
250 aa  325  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  60.38 
 
 
253 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  60.23 
 
 
261 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  61.05 
 
 
268 aa  306  2e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  55 
 
 
255 aa  301  6e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  57.92 
 
 
252 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  56.76 
 
 
254 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  56.54 
 
 
257 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  52.29 
 
 
264 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.62636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  51.54 
 
 
256 aa  269  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.11745e-08  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  50.77 
 
 
255 aa  265  6e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  50.58 
 
 
255 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  55.81 
 
 
266 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  50 
 
 
254 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  51.92 
 
 
254 aa  261  9e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  53.18 
 
 
271 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  55.3 
 
 
267 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  55.3 
 
 
267 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  55.3 
 
 
267 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  54.17 
 
 
270 aa  254  1e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  53.21 
 
 
272 aa  252  4e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  48.65 
 
 
269 aa  252  4e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  251  9e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  47.69 
 
 
262 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  47.31 
 
 
262 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  47.13 
 
 
259 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  47.13 
 
 
259 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  47.31 
 
 
262 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  48.08 
 
 
262 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  47.94 
 
 
258 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.44798e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  48.08 
 
 
255 aa  245  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  46.33 
 
 
258 aa  244  7e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.07258e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  46.54 
 
 
258 aa  244  7e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  47.1 
 
 
255 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.7573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  47.1 
 
 
255 aa  242  4e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  51.94 
 
 
262 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.4908e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.03 
 
 
254 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  47.49 
 
 
254 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  45.56 
 
 
257 aa  238  6e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  46.54 
 
 
255 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  48.69 
 
 
254 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  47.88 
 
 
255 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  46.54 
 
 
254 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  48.54 
 
 
285 aa  234  1e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  45.77 
 
 
254 aa  233  2e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.74 
 
 
254 aa  233  2e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  46.33 
 
 
256 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.16191e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  46.15 
 
 
254 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  44.49 
 
 
258 aa  231  7e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0636  putative transcriptional acitvator, Baf family  53.9 
 
 
273 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  45.96 
 
 
274 aa  228  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.9 
 
 
261 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  49.62 
 
 
254 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  47.13 
 
 
255 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  45.56 
 
 
254 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  46.72 
 
 
254 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  46.33 
 
 
254 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  46.33 
 
 
254 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  46.33 
 
 
255 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  44.4 
 
 
263 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.81986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  43.46 
 
 
258 aa  216  3e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.88548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  42.31 
 
 
257 aa  215  6e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  42.97 
 
 
264 aa  215  6e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.38 
 
 
262 aa  213  3e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  43.02 
 
 
263 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.47608e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.35 
 
 
263 aa  209  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  39.77 
 
 
259 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  42.15 
 
 
266 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  42.53 
 
 
260 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.64 
 
 
270 aa  201  1e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  40.93 
 
 
255 aa  200  2e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  44.53 
 
 
255 aa  198  8e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  41.92 
 
 
257 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  41.92 
 
 
257 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  41.92 
 
 
257 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  40.38 
 
 
260 aa  196  4e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  40.46 
 
 
261 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  41.7 
 
 
255 aa  194  8e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.47 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  38.22 
 
 
256 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  40.08 
 
 
256 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  40.08 
 
 
256 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  40 
 
 
260 aa  184  1e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  40.77 
 
 
259 aa  184  1e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  38.61 
 
 
256 aa  181  8e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.23 
 
 
255 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>