More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4843 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.64 
 
 
557 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  63.08 
 
 
548 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.38 
 
 
569 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.43 
 
 
557 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
521 aa  1070    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.39 
 
 
552 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.64 
 
 
548 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.61 
 
 
548 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.85 
 
 
548 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.5 
 
 
548 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.57 
 
 
548 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.5 
 
 
548 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.08 
 
 
548 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.97 
 
 
548 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.84 
 
 
562 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.58 
 
 
548 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.27 
 
 
548 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.2 
 
 
548 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  63.08 
 
 
548 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.69 
 
 
548 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.43 
 
 
557 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.39 
 
 
557 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.81 
 
 
557 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.81 
 
 
551 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.57 
 
 
555 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.27 
 
 
548 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.43 
 
 
557 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.81 
 
 
557 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.61 
 
 
548 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.43 
 
 
557 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.24 
 
 
556 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  60.8 
 
 
548 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.69 
 
 
548 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.69 
 
 
548 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.88 
 
 
557 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.04 
 
 
548 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.61 
 
 
548 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.43 
 
 
557 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.27 
 
 
548 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.27 
 
 
548 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.88 
 
 
548 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  60.5 
 
 
548 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.93 
 
 
558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.22 
 
 
578 aa  587  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.75 
 
 
583 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.56 
 
 
583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.89 
 
 
573 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  52.21 
 
 
572 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  51.6 
 
 
565 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.28 
 
 
570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.09 
 
 
570 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.09 
 
 
570 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.09 
 
 
570 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.85 
 
 
569 aa  514  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.97 
 
 
555 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  47.46 
 
 
564 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.48 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.81 
 
 
555 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  48.87 
 
 
567 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  58.47 
 
 
421 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.96 
 
 
571 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.15 
 
 
570 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.29 
 
 
571 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.45 
 
 
563 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.33 
 
 
554 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.48 
 
 
573 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.93 
 
 
558 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.35 
 
 
559 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.96 
 
 
571 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.16 
 
 
636 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.57 
 
 
563 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.53 
 
 
588 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.86 
 
 
568 aa  488  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.6 
 
 
593 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.95 
 
 
587 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.01 
 
 
592 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.9 
 
 
591 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.72 
 
 
591 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  45.49 
 
 
562 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.9 
 
 
591 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.13 
 
 
587 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.34 
 
 
552 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.62 
 
 
554 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.73 
 
 
582 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.84 
 
 
587 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.34 
 
 
562 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.78 
 
 
582 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.31 
 
 
617 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.52 
 
 
591 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05901  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.84 
 
 
587 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.54 
 
 
587 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.47 
 
 
558 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.57 
 
 
618 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.49 
 
 
612 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.48 
 
 
553 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.04 
 
 
602 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.91 
 
 
587 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.12 
 
 
562 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.46 
 
 
592 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  45.52 
 
 
577 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>