More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2603 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  100 
 
 
478 aa  984    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  62.55 
 
 
478 aa  637    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  70.35 
 
 
478 aa  718    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  50.11 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  49.17 
 
 
470 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  48.33 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  48.33 
 
 
475 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  46.97 
 
 
470 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  47.7 
 
 
474 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  46.7 
 
 
461 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  43.19 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  44.44 
 
 
469 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  45.59 
 
 
466 aa  394  1e-108  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  44.33 
 
 
464 aa  384  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  41.68 
 
 
469 aa  377  1e-103  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4075  glycoside hydrolase family 1  40.46 
 
 
467 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  42.07 
 
 
479 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  40.72 
 
 
455 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.6 
 
 
479 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.2 
 
 
479 aa  359  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.4 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  40 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  40.29 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.29 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.4 
 
 
479 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  40 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.29 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.29 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  40.65 
 
 
479 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.29 
 
 
477 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  40.08 
 
 
477 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  40.64 
 
 
480 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  41.8 
 
 
478 aa  350  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  38.77 
 
 
478 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  39.76 
 
 
478 aa  349  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  41.06 
 
 
446 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  39.88 
 
 
478 aa  346  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  39.84 
 
 
480 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  39.96 
 
 
478 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  40.47 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  39.75 
 
 
478 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  40.04 
 
 
465 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  40.29 
 
 
463 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
477 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  40.28 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  39.2 
 
 
475 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  37.92 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  39.67 
 
 
463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  40.04 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  40.28 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  39.59 
 
 
475 aa  336  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  38.84 
 
 
473 aa  335  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  38.77 
 
 
478 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  39.83 
 
 
467 aa  335  9e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  38.57 
 
 
478 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  39.12 
 
 
479 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  39.03 
 
 
479 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  37.99 
 
 
465 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 
478 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  40.62 
 
 
471 aa  333  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  41.08 
 
 
468 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  40.87 
 
 
466 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  37.99 
 
 
465 aa  333  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1637  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  42.19 
 
 
454 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  38.72 
 
 
479 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.25 
 
 
486 aa  330  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  38.64 
 
 
475 aa  330  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1584  glycoside hydrolase family 1  37.98 
 
 
451 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  38.55 
 
 
479 aa  329  6e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  39.45 
 
 
471 aa  329  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  37.55 
 
 
480 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  38.64 
 
 
462 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  38.34 
 
 
480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  40.61 
 
 
496 aa  325  9e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  39.15 
 
 
478 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.87 
 
 
485 aa  325  1e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  39.71 
 
 
452 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  35.45 
 
 
496 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  38.43 
 
 
462 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  37.71 
 
 
453 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  38.38 
 
 
444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  39.26 
 
 
480 aa  320  5e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  38.45 
 
 
474 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  37.6 
 
 
474 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  37.97 
 
 
464 aa  319  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  39.67 
 
 
465 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  38.45 
 
 
474 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  37.76 
 
 
470 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  38.24 
 
 
474 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
470 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  37.55 
 
 
464 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  37.53 
 
 
476 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  38.9 
 
 
478 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  37.76 
 
 
470 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  38.9 
 
 
478 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  38.38 
 
 
438 aa  316  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  39.51 
 
 
465 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>