178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0557 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  100 
 
 
307 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  98.05 
 
 
307 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  54.3 
 
 
305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  54.3 
 
 
305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  57.24 
 
 
306 aa  346  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  56.03 
 
 
306 aa  338  5e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  46.36 
 
 
306 aa  295  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  44.88 
 
 
309 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  43.89 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  44.55 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  44.55 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  44.22 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  44.04 
 
 
307 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  46.03 
 
 
308 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  42.68 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  42.68 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  42.04 
 
 
326 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  42.04 
 
 
326 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  42.04 
 
 
326 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  41.72 
 
 
326 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  41.72 
 
 
326 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  42.04 
 
 
326 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  43.42 
 
 
624 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  43.52 
 
 
343 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  43.19 
 
 
343 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  41.64 
 
 
334 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  41.25 
 
 
318 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  44.03 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  41.84 
 
 
412 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  42.33 
 
 
309 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0246  glutaminase  42 
 
 
313 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  40.14 
 
 
331 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  40.46 
 
 
613 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  38.91 
 
 
624 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  40.53 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  40.83 
 
 
310 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  37.91 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  38.24 
 
 
302 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.11 
 
 
601 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  40.14 
 
 
310 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  39.32 
 
 
425 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  38.74 
 
 
308 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  40.07 
 
 
311 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  41.78 
 
 
306 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  38.74 
 
 
308 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  38.74 
 
 
308 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  38.08 
 
 
309 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  40.14 
 
 
310 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  38.24 
 
 
338 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  40.14 
 
 
310 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  39.87 
 
 
306 aa  215  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  40.14 
 
 
310 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  40.14 
 
 
310 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  39.79 
 
 
310 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  39.79 
 
 
310 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  39.79 
 
 
310 aa  215  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.48 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  40.2 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  41.52 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  40.13 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  37.88 
 
 
422 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  39.8 
 
 
309 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.34 
 
 
306 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  37.1 
 
 
302 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  38.41 
 
 
316 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  39.54 
 
 
306 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  40.83 
 
 
311 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  39 
 
 
309 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  40.69 
 
 
315 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  39.33 
 
 
309 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  39.66 
 
 
304 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  41.02 
 
 
309 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  38.08 
 
 
306 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  39.93 
 
 
303 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  40.26 
 
 
309 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  41.24 
 
 
309 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  36.45 
 
 
306 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  38.46 
 
 
483 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  39.61 
 
 
309 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  38.83 
 
 
316 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  38.44 
 
 
309 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  36.09 
 
 
304 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  39 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  36.45 
 
 
302 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  37.63 
 
 
304 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  38.08 
 
 
304 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  37.09 
 
 
304 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  38.41 
 
 
418 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  36.09 
 
 
307 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  36.42 
 
 
308 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  36.07 
 
 
332 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  36.42 
 
 
308 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  36.42 
 
 
308 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>