178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1254 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  100 
 
 
306 aa  631  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  61.51 
 
 
306 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  55.41 
 
 
307 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  56.03 
 
 
307 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  45.21 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  45.21 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0246  glutaminase  46.03 
 
 
313 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  45.05 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  40.4 
 
 
306 aa  242  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  40.28 
 
 
307 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  39.27 
 
 
309 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  39.27 
 
 
309 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  38.61 
 
 
309 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  38.94 
 
 
309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  38.26 
 
 
308 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  38.26 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  38.87 
 
 
613 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  38.26 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  40.83 
 
 
412 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  35.43 
 
 
308 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  35.43 
 
 
308 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  35.43 
 
 
308 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  39.4 
 
 
326 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  39.4 
 
 
326 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  38.91 
 
 
309 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  40.13 
 
 
624 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  38.74 
 
 
326 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  37.67 
 
 
309 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  36.3 
 
 
302 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  36.93 
 
 
310 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  37.67 
 
 
311 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  37.66 
 
 
306 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  36.27 
 
 
310 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  36.07 
 
 
309 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  37.05 
 
 
309 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  37.05 
 
 
309 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  35.95 
 
 
310 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  37.46 
 
 
311 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  36.88 
 
 
309 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  36.68 
 
 
620 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  37.15 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  39.14 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  36.27 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  36.27 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  36.27 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  36.27 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  35.95 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  35.95 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  34.98 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  36.09 
 
 
307 aa  198  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  39.16 
 
 
601 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  35.31 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  37.21 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  33.44 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  33.44 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  35.86 
 
 
306 aa  195  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  35.97 
 
 
306 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  34.44 
 
 
307 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  37.04 
 
 
425 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  36.33 
 
 
308 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  35.79 
 
 
624 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  33.77 
 
 
308 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  33.77 
 
 
308 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  35.07 
 
 
311 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  33.99 
 
 
316 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  35.99 
 
 
331 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  35.43 
 
 
304 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  36.63 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  35.18 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  33.44 
 
 
308 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  33.44 
 
 
308 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  33.44 
 
 
308 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  36.49 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  35.93 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  33.44 
 
 
308 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  35.27 
 
 
313 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  33.11 
 
 
308 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  36.39 
 
 
483 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  35.08 
 
 
315 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  35.1 
 
 
309 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  36.12 
 
 
343 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>