157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2804 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  98.82 
 
 
510 aa  993  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  100 
 
 
510 aa  1002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  35.53 
 
 
539 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  32.68 
 
 
517 aa  275  1e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  34.88 
 
 
526 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  34.24 
 
 
535 aa  246  5e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 
515 aa  245  1e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  33.08 
 
 
534 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  32.54 
 
 
535 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.8595e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  31.17 
 
 
544 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  29.12 
 
 
512 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  30.98 
 
 
538 aa  217  3e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  32.06 
 
 
513 aa  216  1e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  30.98 
 
 
538 aa  214  3e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  28.21 
 
 
516 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 
517 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 
522 aa  200  4e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
514 aa  198  2e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  28.66 
 
 
522 aa  186  1e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  26.76 
 
 
517 aa  186  1e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  27.24 
 
 
519 aa  185  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  27.04 
 
 
519 aa  184  4e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  30.77 
 
 
520 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  27.06 
 
 
519 aa  183  8e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  182  9e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  182  9e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4659e-06 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  26.65 
 
 
519 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
517 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  29.01 
 
 
506 aa  165  2e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.39702e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
518 aa  165  2e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 
514 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  28.73 
 
 
506 aa  164  4e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
542 aa  164  4e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  28.95 
 
 
520 aa  164  4e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  28.73 
 
 
506 aa  164  4e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 
506 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  28.54 
 
 
506 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  28.73 
 
 
506 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  29.23 
 
 
544 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  28.6 
 
 
544 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  28.6 
 
 
506 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  28.6 
 
 
544 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  27.86 
 
 
506 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  2.48278e-11 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  28.81 
 
 
544 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
529 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
519 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  27.67 
 
 
506 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  28.6 
 
 
544 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
541 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
544 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  28.18 
 
 
544 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 
544 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  28.39 
 
 
544 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  29.11 
 
 
533 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  28.73 
 
 
533 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 
564 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
459 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
459 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
506 aa  149  1e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  26.29 
 
 
529 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  27.07 
 
 
459 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  27.07 
 
 
459 aa  147  4e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  27.29 
 
 
459 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  27.29 
 
 
459 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 
550 aa  147  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  29.42 
 
 
533 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  26.86 
 
 
459 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  26.86 
 
 
459 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  29.06 
 
 
533 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  26.64 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  26.64 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  26.64 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  27.79 
 
 
550 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  28.15 
 
 
550 aa  142  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  28.68 
 
 
533 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  27.93 
 
 
550 aa  140  4e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  27.93 
 
 
550 aa  140  4e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  29.04 
 
 
533 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  29.04 
 
 
533 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  28.68 
 
 
533 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  28.85 
 
 
533 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  28.32 
 
 
533 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
550 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  27.39 
 
 
554 aa  134  4e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  26.88 
 
 
552 aa  134  4e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.46874e-05  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1390  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.81 
 
 
544 aa  130  4e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.106495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
553 aa  129  9e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
553 aa  129  9e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
509 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.92741e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 
509 aa  120  8e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.10979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 
509 aa  119  1e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>