178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0571 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  98.05 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  55.3 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  55.3 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  57.89 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  55.41 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  46.69 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  45.54 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  45.21 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  44.88 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  43.89 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  43.89 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  43.38 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  45.36 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  44.08 
 
 		 624 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  42.36 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  42.36 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  41.72 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  41.72 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  41.72 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  41.72 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  41.4 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  41.4 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  44.37 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  41.58 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  44.03 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  42.41 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  44.64 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  43 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  42.52 
 
 		 412 aa  235  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0246  glutaminase  42.33 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  40.83 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  40.79 
 
 		 613 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  39.25 
 
 		 624 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  38.56 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  38.24 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 		 601 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  40.53 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  40.83 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  40.07 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  40.14 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  38.74 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  38.74 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  38.74 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  38.08 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  39.32 
 
 		 425 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  39.04 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  39.87 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  40.14 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  40.14 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  40.14 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  40.14 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  40.41 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  39.79 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  40.83 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  39.79 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  39.79 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.48 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  41.38 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  41.12 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  40.45 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  38.74 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.67 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  37.88 
 
 		 422 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  40 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  37.1 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  41.03 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  40.69 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  37.1 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  39 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  39.33 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  41.02 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  38.08 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  40.26 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  38.8 
 
 		 483 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  39.93 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  39.16 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  36.75 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  39.73 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  37.22 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  38.44 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  36.42 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  41.24 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  39 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  39.61 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  37.42 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  36.45 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  36.75 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  36.75 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  38.08 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  41.3 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  37.42 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  36.75 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>