29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1032 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0409  lipolytic protein G-D-S-L family  47.6 
 
 
242 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3367  lipolytic protein G-D-S-L family  49.73 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6590  lipolytic protein G-D-S-L family  49.18 
 
 
235 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  47.15 
 
 
212 aa  184  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1288  GDSL family lipase  44.07 
 
 
254 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  42.33 
 
 
222 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00120  hypothetical protein  40.53 
 
 
230 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  25.26 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  26.8 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  27.59 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  25.93 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  23.35 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  25.56 
 
 
213 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  25.11 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  23.5 
 
 
348 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 
216 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  34.19 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  23.12 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  22.51 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  26.87 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  24.61 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  24.46 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  25.85 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 
218 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  29.75 
 
 
249 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  26.88 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>