27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6590 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6590  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
235 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  51.27 
 
 
222 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0409  lipolytic protein G-D-S-L family  45.7 
 
 
242 aa  191  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3367  lipolytic protein G-D-S-L family  50.53 
 
 
205 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  49.18 
 
 
223 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  52.46 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00120  hypothetical protein  36.82 
 
 
230 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1288  GDSL family lipase  41.31 
 
 
254 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  26.18 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  28.35 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  23.98 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  28.06 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  26.49 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  25.95 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  26.49 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  25.41 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  25.41 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  25.41 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  25.41 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  25.95 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92059  predicted protein  22.01 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1762  lipolytic protein G-D-S-L family  36.21 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  24.86 
 
 
197 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 
214 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0975  hypothetical protein  41.82 
 
 
231 aa  42  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>