More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1694 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
195 aa  408  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  79.57 
 
 
190 aa  322  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  79.03 
 
 
190 aa  319  1e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  74.87 
 
 
190 aa  311  5e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  73.71 
 
 
194 aa  310  8e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  74.33 
 
 
190 aa  309  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  74.33 
 
 
190 aa  308  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  74.21 
 
 
193 aa  307  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  73.26 
 
 
190 aa  303  1e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  73.18 
 
 
179 aa  286  9e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  60.56 
 
 
226 aa  243  2e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 
216 aa  239  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
212 aa  238  3e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 
223 aa  238  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  59.66 
 
 
219 aa  238  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 
219 aa  238  6e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 
214 aa  237  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 
214 aa  237  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
216 aa  236  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  60.8 
 
 
218 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  59.2 
 
 
218 aa  234  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  58.14 
 
 
202 aa  234  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
223 aa  233  1e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  59.09 
 
 
239 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  59.09 
 
 
239 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  58.76 
 
 
198 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 
213 aa  228  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  54.59 
 
 
199 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  58.01 
 
 
185 aa  228  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 
185 aa  228  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 
247 aa  227  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  58.86 
 
 
235 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
181 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
181 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 
189 aa  224  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  57.39 
 
 
235 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
181 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  57.4 
 
 
184 aa  222  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
220 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
181 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  53.51 
 
 
243 aa  221  5e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
213 aa  221  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
181 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 
235 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 
187 aa  220  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
187 aa  220  1e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
181 aa  219  1e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
186 aa  219  1e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  58.33 
 
 
186 aa  219  2e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  56.73 
 
 
179 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  58.05 
 
 
226 aa  218  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
186 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
186 aa  218  4e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  54.02 
 
 
201 aa  218  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  56.55 
 
 
186 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  56.55 
 
 
186 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
181 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  55.95 
 
 
186 aa  215  3e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 
184 aa  214  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 
188 aa  214  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  56.8 
 
 
199 aa  214  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  55.23 
 
 
193 aa  214  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
181 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 
180 aa  214  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  51.34 
 
 
195 aa  212  2e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 
225 aa  211  5e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 
203 aa  211  6e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  53.71 
 
 
210 aa  211  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
184 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
224 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
206 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 
190 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  51.14 
 
 
186 aa  207  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 
202 aa  207  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
179 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
179 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
182 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  51.08 
 
 
209 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  49.73 
 
 
270 aa  205  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 
181 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 
181 aa  205  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 
181 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  58.08 
 
 
200 aa  204  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 
220 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
206 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 
213 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 
213 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  48.9 
 
 
435 aa  201  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
201 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
201 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
201 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 
207 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
202 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 
202 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  51.32 
 
 
219 aa  200  1e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 
210 aa  199  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
199 aa  199  2e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  51.6 
 
 
257 aa  197  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  48.94 
 
 
258 aa  197  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 
211 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>