More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1574 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0001  MoeB/ThiF family protein  76.42 
 
 
219 aa  323  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000255944  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.41 
 
 
214 aa  262  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0324  MoeB/thiF family protein  62.56 
 
 
215 aa  237  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0318  thiF family protein  60.55 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0340  thiF family protein  60.65 
 
 
216 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1382  HesA/MoeB/ThiF family protein  59.07 
 
 
217 aa  209  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1669  thiF family protein  58.8 
 
 
216 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1314  ThiF family protein  52.8 
 
 
226 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1535  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.38 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.79 
 
 
242 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.49 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.71 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 
244 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.25 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.9 
 
 
254 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.8 
 
 
242 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.91 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.08 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.87 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.7 
 
 
261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.02 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.79 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  34.39 
 
 
252 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.9 
 
 
259 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.77 
 
 
253 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  36.36 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  36.36 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  36.55 
 
 
247 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  36.36 
 
 
268 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.31 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.8 
 
 
254 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  37.11 
 
 
275 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.11 
 
 
275 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  37.11 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  36.73 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.69 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.5 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  40.61 
 
 
258 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000394678  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.03 
 
 
255 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  38.66 
 
 
255 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  39 
 
 
273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
258 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.18 
 
 
242 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 
258 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  35.18 
 
 
266 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.57 
 
 
272 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.41 
 
 
244 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.57 
 
 
270 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  35.43 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.29 
 
 
255 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.69 
 
 
277 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.34 
 
 
255 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  34.78 
 
 
266 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  38.34 
 
 
255 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.34 
 
 
254 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
268 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  37.5 
 
 
269 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.94 
 
 
263 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.18 
 
 
277 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.76 
 
 
253 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.76 
 
 
253 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  40.11 
 
 
272 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  33.86 
 
 
276 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
341 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.49 
 
 
249 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.83 
 
 
243 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.95 
 
 
286 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.98 
 
 
264 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.92 
 
 
285 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 
275 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.82 
 
 
246 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  36.95 
 
 
285 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.51 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.8 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  38.66 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000336589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  38.66 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
288 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>