25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3437 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  741    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  78.53 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  70.82 
 
 		 344 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  70.21 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.97 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  66.27 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  64.65 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  56.05 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  53.91 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  48.17 
 
 		 355 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  48.34 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  41.45 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  43.81 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  41.82 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  43.67 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  43.37 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  43.37 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  43.07 
 
 		 342 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  43.37 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  43.15 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  43.37 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  43.37 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  42.95 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  26.84 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  32.14 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>