28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2768 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  86.91 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  71.59 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  59.85 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  59.85 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  36.29 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  36.43 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  36.82 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  35.29 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  35.84 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  36.67 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  35.41 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  36.73 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  32.93 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  32.03 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  36.19 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  35.84 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  33.87 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  34.66 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  33.6 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  38.07 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  36.65 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  29.5 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  29.44 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  32.42 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  31.36 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  31.74 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  28.88 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>