36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5151 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  44.59 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  44.59 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  35.16 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  34.04 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  30.69 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  29.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  29.17 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  32.63 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  30.86 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  32.63 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  27.66 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  32.22 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  36.26 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  36.26 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  24.18 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  28.79 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  28.79 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  27.66 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  26.32 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  25 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  32.38 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  27.72 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  30.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  30.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  25.51 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  28.87 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  22.47 
 
 		 103 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>