33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4942 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 
316 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  92.41 
 
 
316 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  74.37 
 
 
317 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  69.3 
 
 
317 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  68.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  68.91 
 
 
316 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  68.47 
 
 
315 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  57.62 
 
 
327 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.42 
 
 
327 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  51.89 
 
 
310 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  50.63 
 
 
310 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  42.99 
 
 
324 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.16 
 
 
310 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.27 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  34.05 
 
 
312 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.8 
 
 
291 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.72 
 
 
315 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.58 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  33.02 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  41.18 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.21 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  39.51 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.14 
 
 
551 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  40 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  38.67 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  36 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  59.38 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0933  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  51.35 
 
 
277 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>