16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1498 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  784    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  70.81 
 
 
395 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  48.79 
 
 
412 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  46.83 
 
 
314 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  25.94 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  24.87 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.27 
 
 
262 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  25.31 
 
 
262 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  20.83 
 
 
272 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  23.86 
 
 
302 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  23.1 
 
 
939 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  32.74 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  19.59 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  22.67 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  24.56 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>