21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6348 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  506  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  55.7 
 
 
309 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  45.85 
 
 
253 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  37.02 
 
 
236 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  35.97 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  37.19 
 
 
254 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  34.15 
 
 
261 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  34.94 
 
 
252 aa  140  1e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  36.22 
 
 
253 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  36.22 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  36.22 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  31.11 
 
 
267 aa  126  4e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  31.58 
 
 
266 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  30.97 
 
 
267 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  28.46 
 
 
261 aa  77.4  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  23.95 
 
 
263 aa  53.1  5e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.96 
 
 
265 aa  52  8e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  26.27 
 
 
275 aa  52  8e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  26.27 
 
 
275 aa  52  8e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.26 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.79 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>