69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0389 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  100 
 
 
578 aa  1168    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  25.84 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  26.44 
 
 
622 aa  140  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  26.17 
 
 
459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  24.95 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  27.97 
 
 
532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  27.95 
 
 
542 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24.15 
 
 
629 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  24.37 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  23.93 
 
 
653 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  26.74 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  25.45 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  27.81 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  27.62 
 
 
462 aa  110  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  25 
 
 
463 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  27.7 
 
 
455 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  23.48 
 
 
660 aa  108  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  22.96 
 
 
501 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  26.82 
 
 
634 aa  103  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  23.58 
 
 
467 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  28.92 
 
 
546 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  26.54 
 
 
455 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  25.36 
 
 
546 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  23.32 
 
 
554 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  25.87 
 
 
562 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  25.87 
 
 
562 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  25.87 
 
 
562 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  27.71 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  25.14 
 
 
541 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  25.87 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  26.2 
 
 
555 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  25.96 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  25.66 
 
 
563 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  25.66 
 
 
563 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  26.09 
 
 
562 aa  91.3  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  28.53 
 
 
456 aa  91.3  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  28.69 
 
 
527 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  25.15 
 
 
556 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  24.22 
 
 
563 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  24.18 
 
 
556 aa  87.4  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  25.27 
 
 
530 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  26.85 
 
 
544 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  21.69 
 
 
534 aa  87  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  27.35 
 
 
484 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  23.62 
 
 
555 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  22.89 
 
 
556 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  25.54 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  22.99 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  22.46 
 
 
545 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  28.78 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  23.62 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  26.3 
 
 
525 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  24.91 
 
 
728 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  23.77 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  26.29 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  31.48 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  23.01 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  21.33 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  23.75 
 
 
381 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  21.04 
 
 
378 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  26.17 
 
 
603 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  24.15 
 
 
547 aa  57.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  21.95 
 
 
552 aa  57.4  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  20.81 
 
 
556 aa  53.9  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  26.29 
 
 
598 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  24.37 
 
 
371 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  26.57 
 
 
378 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  22.18 
 
 
574 aa  44.3  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  26.71 
 
 
603 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>